IASA-astronaut John Crichton probeert met behulp van de aarde's atmosfeer zijn schip een grote snelheid te geven. De test om zo met een snelheid Farscape 1 het zonnestelsel te doorkruisen mislukt. Hij komt veel verder terecht en wordt door een wormgat naar een ander deel van ons melkwegstelsel getrokken. Daar belandt hij midden in een ruimtegevecht.

Crichton wordt ‘gered’ door een groep ontsnapte gevangenen. Ze vluchten op een levend schip, Moya, gestolen van de Peacekeepers. Achternagezeten door een op wraak beluste Peacekeeper zoeken John, Aeryn, D’Argo, Zhaan en Rygel hun weg naar huis. Op hun trip maakt dit bondgenootschap zowel nieuwe vrienden (Chiana) als nieuwe vijanden (Scorpius).

Het leven van John in deze vreemde wereld wordt nog moeilijker als Scorpius ontdekt dat John over wormgatkennis beschikt. John wordt hierdoor een spilfiguur in een galactisch gevecht tussen de twee grootmachten, de Peacekeepers en de Scarrans. Beide groepen hebben deze krachtige technologie nodig om hun oorlog in een beslissende fase te duwen. John moet nu zowel deze technologie geheim houden, als zijn grote liefde in leven houden en moet bovendien de Aarde beschermen.

Rockne S. O'Bannon is samen met Brian Henson (zoon van Jim Henson) de maker van deze serie. Brian wilde al een tijd laten zien dat het bedrijf "Henson Creature Shop" meer kon dan alleen maar poppen maken zoals daar zijn de Muppets en de Freggles. Met deze serie maakte Henson niet enkel heel aparte buitenaardse wezens. Farscape is bovendien de meest fantasierijke science-fiction ooit met heel krachtige verhaallijnen!